More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3189 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  205  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  85.58 
 
 		 104 aa  184  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  63.46 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  57.43 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  54.37 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.48 
 
 		 223 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  53.92 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  55.24 
 
 		 221 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.43 
 
 		 198 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>