More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1113 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  100 
 
 		 118 aa  233  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 224 aa  113  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 208 aa  103  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  43.44 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  46.67 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  45.71 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  45.19 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  44.34 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  44.95 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  42.74 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  44.04 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  37.29 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.79 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>