More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2695 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 120 aa  240  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  85.83 
 
 		 120 aa  205  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 103 aa  144  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  60.58 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  50 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  48.48 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.23 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.14 
 
 		 198 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  42.57 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  39.82 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.16 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  43 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  45 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  84.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  41.07 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  40.82 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>