More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0314 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 
208 aa  114  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  56.19 
 
 
103 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 
224 aa  102  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  46.67 
 
 
103 aa  94.4  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.81 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  50.48 
 
 
103 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  50.48 
 
 
103 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  49.52 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45.71 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.71 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  49.04 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  45.71 
 
 
104 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  41.9 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  40 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  39.42 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  38.1 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  45.92 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  38.83 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  36.19 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  36.19 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  36.19 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  45.16 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  43.88 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  39.05 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  37.14 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  41.51 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  37.14 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  43 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  42.86 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  38.1 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  36.19 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0805  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>