More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1465 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  63.84 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  81.19 
 
 		 147 aa  151  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 103 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  124  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 103 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  35.29 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 		 105 aa  114  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  38.89 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 105 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 100 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 		 104 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 114 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  35.53 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  95.5  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  94.7  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  38.83 
 
 		 103 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  92.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  43.88 
 
 		 100 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 125 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  40.68 
 
 		 130 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  37.96 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  41.53 
 
 		 134 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 102 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  30.1 
 
 		 223 aa  88.2  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  40.95 
 
 		 105 aa  88.2  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  39.68 
 
 		 130 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 131 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  39.83 
 
 		 134 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  38.98 
 
 		 132 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  86.3  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  41.75 
 
 		 149 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  35.48 
 
 		 136 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.59 
 
 		 258 aa  85.5  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  34.68 
 
 		 131 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 102 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 102 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 133 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 102 aa  85.1  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  34.68 
 
 		 131 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  36.59 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  34.48 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 118 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>