More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2481 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  100 
 
 		 105 aa  209  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  73.79 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 208 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 224 aa  121  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  64.76 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  48.57 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50.48 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 100 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  47.62 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  43 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.23 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  41.35 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  39.05 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  42.99 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  49.07 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.38 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  40.57 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  35.92 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  40.19 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>