More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1624 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  205  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 208 aa  146  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 224 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  64.36 
 
 		 103 aa  136  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  64.76 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.02 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  43.14 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  44.12 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  45.1 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  93.2  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  43.14 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>