More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0484 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  100 
 
 		 105 aa  213  8e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.66 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.23 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  50 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  91.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0701  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.763795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  46 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.76 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  44.76 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  44.76 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  44.76 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>