More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4414 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
130 aa  257  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
130 aa  257  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  96.58 
 
 
130 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  82.69 
 
 
104 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  78.85 
 
 
105 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
104 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  53.28 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  75.96 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 
105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 
124 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 
125 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  60 
 
 
188 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  60 
 
 
129 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  60 
 
 
142 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  54.78 
 
 
223 aa  120  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  51.35 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  49.06 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
104 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
103 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 
104 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.96 
 
 
103 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
103 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  57.58 
 
 
100 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
102 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  103  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.17 
 
 
198 aa  103  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
115 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 
115 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  47.33 
 
 
140 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.76 
 
 
105 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
132 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  53.45 
 
 
128 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  55.37 
 
 
230 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  100  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  41.35 
 
 
104 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 
104 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
102 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.11 
 
 
221 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  51.22 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
102 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2142  ribosomal protein L21  58.62 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  51.72 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
103 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  47.69 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  50.98 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  45.28 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  47.57 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  45.28 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45.28 
 
 
258 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>