More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1737 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  202  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  202  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  94.12 
 
 
102 aa  175  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  76.47 
 
 
102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  74.51 
 
 
102 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  156  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  156  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  155  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 
102 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  59.62 
 
 
104 aa  120  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  58.42 
 
 
102 aa  118  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
156 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  56.86 
 
 
149 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  56.73 
 
 
104 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  56.57 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  55.45 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
100 aa  108  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  52.94 
 
 
104 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 
103 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
100 aa  107  6e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  49.51 
 
 
103 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
104 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
103 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  55.34 
 
 
132 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  56.57 
 
 
99 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  103  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
105 aa  104  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
104 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  48.54 
 
 
114 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
101 aa  102  1e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
101 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 
103 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  101  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>