More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0086 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
104 aa  207  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  59.22 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  54.46 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 
104 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
132 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  51.96 
 
 
105 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  110  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  48.08 
 
 
104 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
102 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
115 aa  106  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
102 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 
115 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 
157 aa  104  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  103  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
105 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  103  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
130 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
130 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
104 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
104 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
104 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
104 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
104 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.57 
 
 
223 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
130 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 
105 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 
104 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>