More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0678 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  53 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  51.02 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  48.51 
 
 		 100 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  52.53 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  49.49 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  45.28 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  55.45 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000143169  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05960  LSU ribosomal protein L21P  60 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  0.000000000000252573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  47.42 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  41.32 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  41.32 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2013  ribosomal protein L21  57 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  40.5 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  47.47 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  39.6 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  38.1 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  40.59 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42.57 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 114 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  44.33 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  44.66 
 
 		 221 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  40.19 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  38.61 
 
 		 104 aa  83.6  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.08 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>