More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1588 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 104 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 104 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  67.96 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  69.57 
 
 		 104 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  65.35 
 
 		 103 aa  130  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  69.57 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  69.57 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  69.57 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  61 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  66.3 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  66.3 
 
 		 103 aa  126  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  65 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  63 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  66.3 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  66.3 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  64.95 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  64.36 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  66 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  59.62 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  62.37 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  69.07 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  67.01 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  62 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  57 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  53.61 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  61 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  58.33 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  52.58 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  44 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  47 
 
 		 114 aa  87.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  44.33 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  46.39 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  39.22 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  42 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  45.36 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  45.36 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  39.6 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  42.71 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.2 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  43.75 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  42.71 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>