More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1503 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  201  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 104 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 104 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 		 104 aa  150  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  71.72 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  71.29 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  72.73 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  72.73 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  72.73 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 107 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  70 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 105 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  68 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  66 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  64.42 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  119  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  53.47 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  59 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  60 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  54.46 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  61 
 
 		 106 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  57 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  49.5 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  47.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  53 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.23 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  47 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  53 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  44.12 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  48.98 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  48.98 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  42.57 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  48.98 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  42 
 
 		 95 aa  84.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>