More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1622 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  100 
 
 		 101 aa  196  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  72.28 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  68.63 
 
 		 102 aa  140  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  133  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  68.32 
 
 		 102 aa  133  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  78.22 
 
 		 106 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  78.22 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  63 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  60.4 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  72.28 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  62 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  62 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  59.41 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  60.61 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  53 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  57 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  52.88 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  57.58 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  57.58 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  46.46 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  43.43 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  38 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  44.55 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  38.24 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>