More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1547 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  66.35 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  61.76 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  59.8 
 
 		 100 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  59 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  120  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  54.81 
 
 		 104 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  54 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  62 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  56.73 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  58 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  54 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  53 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  59 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  52.53 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  56 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  52 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  40.78 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  43 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0771  ribosomal protein L21  40 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  42 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.78 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  37.86 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  42 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>