More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2216 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 99 aa  199  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  46.46 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  44 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  44.44 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  45.92 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  45 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  38.46 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  43.88 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  40 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  39.62 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  43.88 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  43.88 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  37 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  43.43 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  40.4 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  39.62 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>