More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2460 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  80.2 
 
 		 100 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  66.35 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  64 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  60.58 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  61 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  60.58 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  62 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  62.63 
 
 		 103 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  62.38 
 
 		 102 aa  126  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  63 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 102 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  61.62 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  69.31 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  62 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  61.62 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  59 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  68 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  58.49 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  65 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  54.81 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  53 
 
 		 101 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  59 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  38.83 
 
 		 103 aa  85.5  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  43 
 
 		 95 aa  84.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  39.6 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  35.92 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  35.92 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>