More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3457 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  203  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  69.31 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  68 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 101 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  65.35 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  64 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  64.36 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  70.3 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  68.32 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  61 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  63 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  68.32 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 103 aa  120  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  59.05 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  56 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  56.31 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  51.49 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  41 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  44 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  84.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42.57 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  40.59 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000143169  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>