More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  100 
 
 		 106 aa  209  7e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000143169  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2013  ribosomal protein L21  71.29 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  50.96 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  51.52 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05960  LSU ribosomal protein L21P  64 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  0.000000000000252573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  52.53 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  43.88 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  42.45 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  51 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  44.55 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  45.26 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  47.42 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0109  ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  42.42 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  40.78 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>