More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1473 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  88.24 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  84.16 
 
 		 107 aa  173  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  83.17 
 
 		 107 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  81.55 
 
 		 104 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  80.39 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  80.39 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  80.39 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  69.61 
 
 		 104 aa  148  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  74.75 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  67 
 
 		 104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  67 
 
 		 104 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  68.69 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  66 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  67.68 
 
 		 105 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  62.63 
 
 		 104 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  66.3 
 
 		 103 aa  126  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  62.63 
 
 		 102 aa  120  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  56.57 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  56.31 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  67.68 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  62.63 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  53.54 
 
 		 100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  58 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  53 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  53.54 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  62.63 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  52.53 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  51 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  52 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  48 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  47.52 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  46.46 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  41.41 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  48 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  41 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 99 aa  83.6  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  43 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  41 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  44.55 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  44 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.58 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>