More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0090 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  50.48 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  48.11 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  50.94 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.57 
 
 		 103 aa  85.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  45.79 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.71 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  45.71 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.67 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.71 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  44 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.71 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  45.37 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.76 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  42.45 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.72 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  43.93 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.11 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  46.67 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  44.86 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1601  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  37.14 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>