More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3451 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  67 
 
 		 104 aa  133  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  64.36 
 
 		 102 aa  133  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  62 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  63.73 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 104 aa  120  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  60.61 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  60.61 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 103 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  61.62 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  61.62 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  61.62 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  60.61 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  59 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  63 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  58.65 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  62 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  54 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  55.45 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  58 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  60 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  43 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42.72 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.2 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  39.22 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  41.18 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>