More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2283 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  100 
 
 		 106 aa  207  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  81.37 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  85.85 
 
 		 106 aa  163  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  81.37 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  72.28 
 
 		 101 aa  143  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  68.32 
 
 		 102 aa  140  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 104 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  69.31 
 
 		 105 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  70 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  65.71 
 
 		 107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 104 aa  133  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  66.34 
 
 		 101 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  67 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  70.97 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  67.68 
 
 		 103 aa  130  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  66 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  65 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  62 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  65 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  70.3 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  65.66 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  65.38 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 102 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  64 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  61 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 103 aa  121  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  61.54 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  58 
 
 		 100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  47 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  38.14 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.4 
 
 		 221 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  39.6 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  41 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  41.51 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  38.24 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  39.6 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  36.63 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0771  ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>