295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0771 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0771  ribosomal protein L21  100 
 
 		 111 aa  219  9e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  40 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  38.1 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  38.1 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  37.37 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  38.79 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  39 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  35.64 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  37 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  36.73 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  39.8 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  37 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  34.65 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  39.05 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  35.24 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  34 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  40.82 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  37 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_002620  TC0701  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.763795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  31.37 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  32.11 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  34.29 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  35.24 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  35.24 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 107 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  31 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  29.7 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  36.19 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  30.1 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  34.34 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>