More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  100 
 
 		 106 aa  208  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  81.37 
 
 		 102 aa  168  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  85.85 
 
 		 106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  74.51 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  74.51 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  78.22 
 
 		 101 aa  153  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  86.27 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  69.31 
 
 		 102 aa  144  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 105 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  65 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  65 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  62.38 
 
 		 101 aa  130  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  61.9 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  68.82 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  60.95 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  58 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  62 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  64 
 
 		 103 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  62 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 104 aa  123  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  68.32 
 
 		 103 aa  123  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  62.63 
 
 		 103 aa  123  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  63 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  64.65 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  62.5 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  58 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  56 
 
 		 100 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  55.77 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  46.73 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  44 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  40 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  38.24 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  40.57 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  40.57 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>