More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1652 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  77.45 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  78.22 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  86.27 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  81.37 
 
 		 106 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  66.34 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  69.31 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  65.35 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 		 105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  64.36 
 
 		 105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  66 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  68.32 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  62 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  65.66 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  61.39 
 
 		 101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  63 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  64 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  64 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  64 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  62 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  64 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  62.63 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  63 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  61 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  62.63 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  59 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  59 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  56.73 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  45 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  42 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  40.2 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  37 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.57 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  38 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  36.63 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>