More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2635 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  98.13 
 
 		 107 aa  207  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  91.18 
 
 		 103 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  91.18 
 
 		 103 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  91.18 
 
 		 103 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  90.1 
 
 		 104 aa  178  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  84.31 
 
 		 103 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  84.16 
 
 		 103 aa  173  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  74.75 
 
 		 103 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  71.29 
 
 		 104 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  71.72 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 103 aa  143  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 104 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  70 
 
 		 105 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  69.7 
 
 		 104 aa  140  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  66.3 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  63 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  60.61 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  65.71 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  58.59 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  60.95 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  63 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  55.56 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  53.54 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  52 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  57.58 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  51.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  49 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  49 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  44 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  85.9  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  85.9  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  42 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.45 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  85.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.51 
 
 		 221 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  42 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  45 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  44.55 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  38 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>