More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2182 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  204  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  68.93 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 104 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  59.8 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  60 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  60.4 
 
 		 102 aa  123  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  60 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  61 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  51.4 
 
 		 136 aa  103  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  52.58 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  58 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  53.47 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  60 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  49.49 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  51 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  51.52 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  51.52 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  51.52 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  40 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  40 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0771  ribosomal protein L21  39 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197746  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  36.89 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  34.95 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  39 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  31.07 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  31.07 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  33.01 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  31.07 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  33.01 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  40 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  35.64 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  31.07 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  34.29 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  33.01 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>