More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0018 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
102 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44.55 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  85.9  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
104 aa  83.6  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  41.28 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  44.12 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  40.95 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  42.16 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  44.23 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  44.55 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  39.25 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  39.02 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>