More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1616 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  68.32 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  57.84 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 106 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  63.37 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  57.43 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  57 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  54.9 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  58.33 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  57.14 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  52 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  52.94 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  44.12 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.16 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.14 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0356  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.635783  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  39.81 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  40.95 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  39.81 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>