More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  100 
 
 		 104 aa  207  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  78 
 
 		 103 aa  160  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  72.55 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  71.57 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  71.57 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  71.57 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  72.28 
 
 		 107 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  72 
 
 		 104 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  71.29 
 
 		 107 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  71.57 
 
 		 104 aa  147  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 105 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 105 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  67 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  64 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  64.36 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  59.6 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  55.45 
 
 		 100 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  65.66 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  62.63 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  53.54 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  64.65 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  51 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  57.58 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  52 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  48.48 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  48.48 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  48 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  42.57 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  51.52 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000143169  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  40.4 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05960  LSU ribosomal protein L21P  47.47 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  0.000000000000252573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  39.39 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0701  50S ribosomal protein L21  38.1 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.763795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  45 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  42.42 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  43.14 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2013  ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  44.33 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>