More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2013 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2013  ribosomal protein L21  100 
 
 		 138 aa  266  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  72.64 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000143169  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05960  LSU ribosomal protein L21P  68 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  0.000000000000252573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  49.49 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  50.51 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  48.45 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  45.45 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  46.46 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  44 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  38.76 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  37.98 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  37.98 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  41.32 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  43 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  41 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  42.15 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  41.32 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  42 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.98 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  41.67 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>