More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1136 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  95.52 
 
 		 134 aa  260  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  93.94 
 
 		 132 aa  254  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  39.06 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  45.79 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  44.9 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  43.3 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  43.3 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  43.3 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  43.3 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.9 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  43.88 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  41.84 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  42.11 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  40.82 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  44.04 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  41.32 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.86 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  41.53 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>