More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05960 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05960  LSU ribosomal protein L21P  100 
 
 		 101 aa  197  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000829272  hitchhiker  0.000000000000252573 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  60 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2013  ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  63.37 
 
 		 106 aa  106  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000143169  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  47.47 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  49 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  95.9  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  48.48 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  45 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 100 aa  91.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  91.3  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.14 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  40 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  84.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  47 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  37 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  38 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  37.62 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>