More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5260 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  97.14 
 
 		 105 aa  202  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  69.23 
 
 		 103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  66.35 
 
 		 104 aa  140  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  70.71 
 
 		 104 aa  141  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  66.35 
 
 		 104 aa  140  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  70.71 
 
 		 104 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  66.35 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  69 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  68 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  67.68 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  60.58 
 
 		 104 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 102 aa  124  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  54 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  64.36 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  65.35 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  53 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  55 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  60 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  59.62 
 
 		 136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  54.9 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  59 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  53 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  43.4 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  45.28 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  45.54 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  46 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  44.55 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0701  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.763795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>