More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7272 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  54.81 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  56.44 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  65.38 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  54.81 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  62.5 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  55.45 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  50.96 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  43.81 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  42.45 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  39.62 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.14 
 
 		 258 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  33.65 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  33.65 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  33.65 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.18 
 
 		 221 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0356  ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.635783  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  40.2 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.38 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  43.4 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  38.1 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  39.42 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>