More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3380 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3380  ribosomal protein L21  100 
 
 		 112 aa  226  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2182  50S ribosomal protein L21  68.93 
 
 		 103 aa  146  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 104 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  63.73 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2460  50S ribosomal protein L21  61 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  62 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 101 aa  120  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  58.42 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2391  50S ribosomal protein L21  59 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0526513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7272  50S ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3457  ribosomal protein L21  64 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2145  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69528e-18 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2260  ribosomal protein L21  58 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5260  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10110  LSU ribosomal protein L21P  55.45 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.56595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1187  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2283  ribosomal protein L21  60 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293262  hitchhiker  0.000417137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1652  ribosomal protein L21  62 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1588  ribosomal protein L21  53.61 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00538788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2059  ribosomal protein L21  52.53 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 107 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3946  50S ribosomal protein L21  52.53 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.664531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  51 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0756  50S ribosomal protein L21P  49.53 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.984095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11400  LSU ribosomal protein L21P  55.34 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103652  hitchhiker  0.00107397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12500  LSU ribosomal protein L21P  47.47 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1616  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151262  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  42.72 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  41 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  37.5 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  36.27 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0771  ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  36.89 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  33.98 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  35.92 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  36.89 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  32.35 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.75 
 
 		 221 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  37.25 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>