More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4723 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 105 aa  206  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  92.38 
 
 		 105 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  67.31 
 
 		 103 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  84.62 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  78.85 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  78.85 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  75.96 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  56.19 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  58.25 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  59.62 
 
 		 223 aa  114  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  56.19 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  53.33 
 
 		 171 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.96 
 
 		 104 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.96 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  47.62 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  65.69 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50 
 
 		 221 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  59.62 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  47.17 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  47.17 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50 
 
 		 198 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.17 
 
 		 258 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  95.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  48.08 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  47.12 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  54.81 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  52.38 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>