More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3461 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45.95 
 
 		 198 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  71.56 
 
 		 188 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.36 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  72.38 
 
 		 142 aa  147  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  52.17 
 
 		 157 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  71.43 
 
 		 129 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.78 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 104 aa  141  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 105 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 105 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 124 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 125 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  49.26 
 
 		 136 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 103 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  57.43 
 
 		 104 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.09 
 
 		 131 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  47.33 
 
 		 131 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  54.55 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 103 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  55.97 
 
 		 146 aa  115  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  48.25 
 
 		 140 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  36.65 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 104 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  35.53 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  65.45 
 
 		 127 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 104 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  55.15 
 
 		 132 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  57.6 
 
 		 128 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  61.47 
 
 		 126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  57.58 
 
 		 100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  62.39 
 
 		 128 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  51.49 
 
 		 103 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 104 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  62.39 
 
 		 128 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 102 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 102 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.08 
 
 		 149 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  59.09 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 105 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  58.18 
 
 		 130 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  58.18 
 
 		 130 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 105 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50.5 
 
 		 103 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  101  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  101  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  101  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  64.71 
 
 		 105 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  101  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  46.85 
 
 		 115 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>