51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1117 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1117  NADH dehydrogenase I chain E  100 
 
 		 211 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160144  normal  0.345455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1719  hypothetical protein  41.82 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  40.52 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  40.62 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  39.82 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2782  hypothetical protein  58.73 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.742585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  37.1 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 		 388 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 		 385 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  42.27 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  46.67 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  48.33 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1723  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 446 aa  58.2  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1789  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0777  hypothetical protein  47.76 
 
 		 517 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3637  hypothetical protein  46.03 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.67 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1114  ABC transporter related  46.67 
 
 		 453 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0650865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3103  hypothetical protein  47.54 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5828  hypothetical protein  40.85 
 
 		 535 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2643  hypothetical protein  27.93 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.86 
 
 		 412 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.11 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  39.74 
 
 		 1253 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  28.64 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.61 
 
 		 230 aa  48.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.36 
 
 		 457 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3827  hypothetical protein  37.31 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1732  hypothetical protein  36.76 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1567  hypothetical protein  35.33 
 
 		 431 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  38.33 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  39.66 
 
 		 355 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.9 
 
 		 412 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.9 
 
 		 412 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  33.68 
 
 		 349 aa  45.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  27.59 
 
 		 349 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  37.7 
 
 		 361 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3150  hypothetical protein  45.9 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  37.5 
 
 		 437 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  29.66 
 
 		 354 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  33.7 
 
 		 1281 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  37.97 
 
 		 626 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  26.72 
 
 		 349 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  36.07 
 
 		 355 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  36.07 
 
 		 355 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0637  hypothetical protein  31.53 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0642  hypothetical protein  31.53 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  35.29 
 
 		 593 aa  42  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1444  hypothetical protein  40.43 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>