19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2652 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  863    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1567  hypothetical protein  60.23 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.86 
 
 		 221 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45.16 
 
 		 198 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  52.17 
 
 		 1253 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  35.79 
 
 		 349 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2931  hypothetical protein  43.55 
 
 		 157 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0484753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3827  hypothetical protein  43.21 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5828  hypothetical protein  41.94 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0777  hypothetical protein  39.68 
 
 		 517 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  39.34 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 744 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  33.07 
 
 		 626 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 208 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1367  hypothetical protein  44.44 
 
 		 272 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3637  hypothetical protein  38.67 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1117  NADH dehydrogenase I chain E  39.68 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160144  normal  0.345455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  46.3 
 
 		 343 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  50 
 
 		 343 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>