125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01305 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  94.54 
 
 		 466 aa  891    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  100 
 
 		 593 aa  1210    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  66.18 
 
 		 477 aa  638    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  70.26 
 
 		 490 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  68.07 
 
 		 603 aa  665    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  68.67 
 
 		 476 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  66.74 
 
 		 451 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  63.96 
 
 		 494 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  59.69 
 
 		 484 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  57.11 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  54.87 
 
 		 451 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  52.99 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  52.13 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  49.46 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  51.63 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  50.11 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  53.54 
 
 		 468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  50.77 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  50.55 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  50.55 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  49.43 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  51.25 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  50 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  48.39 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  44.27 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  47.28 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  44.37 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  43.91 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  45.29 
 
 		 624 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  44.14 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  46.53 
 
 		 624 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  43.22 
 
 		 461 aa  364  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  40.47 
 
 		 445 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  41.61 
 
 		 452 aa  353  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  41.12 
 
 		 448 aa  341  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  42.27 
 
 		 456 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  41.71 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  40.62 
 
 		 472 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  38.79 
 
 		 448 aa  292  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  32.75 
 
 		 674 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  25.25 
 
 		 666 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  24.5 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09026  hypothetical protein  41.23 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0409768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  22.98 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1732  hypothetical protein  52.05 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  23.47 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  22 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  25.45 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1731  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.7 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  29.02 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  51.56 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  23.89 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  24.73 
 
 		 642 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  23.05 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.63 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  24.57 
 
 		 416 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  22.48 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  22.06 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  50.79 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  25.94 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  54.84 
 
 		 385 aa  67  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0777  hypothetical protein  44 
 
 		 517 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  25.87 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  26.09 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  26.8 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  47.06 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  24.09 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  24.59 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  24.49 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  24.2 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  22.69 
 
 		 383 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  48.44 
 
 		 220 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  51.61 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.69 
 
 		 221 aa  62  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5828  hypothetical protein  47.69 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  21.55 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  39.18 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.46 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  47.62 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.87 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  22.65 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1789  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1723  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  43.48 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  22.37 
 
 		 384 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_004310  BR0642  hypothetical protein  42.65 
 
 		 224 aa  57  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0637  hypothetical protein  42.65 
 
 		 224 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.35 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25.26 
 
 		 387 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3827  hypothetical protein  42.65 
 
 		 253 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  42.86 
 
 		 226 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  21.43 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1114  ABC transporter related  46.15 
 
 		 453 aa  54.7  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0650865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2782  hypothetical protein  41.27 
 
 		 193 aa  54.3  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.742585  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.67 
 
 		 442 aa  54.3  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>