14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1732 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1732  PASTA domain containing protein  100 
 
 		 430 aa  849    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.186477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2931  hypothetical protein  48.98 
 
 		 157 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0484753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  48 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0458  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  44.9 
 
 		 464 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  38.67 
 
 		 604 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1367  hypothetical protein  40.38 
 
 		 272 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  40.62 
 
 		 230 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1577  hypothetical protein  35.94 
 
 		 335 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  42.53 
 
 		 636 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.5 
 
 		 645 aa  44.3  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2479  hypothetical protein  48.08 
 
 		 192 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  38.36 
 
 		 335 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.606654 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  30.99 
 
 		 666 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>