More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2972 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  54.17 
 
 		 274 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 274 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  51.18 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  52.76 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  54.33 
 
 		 194 aa  120  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 342 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  49.54 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  49.54 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  54.78 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 332 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 322 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50 
 
 		 238 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 375 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 333 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  51.22 
 
 		 333 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  49.59 
 
 		 342 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 333 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  44.59 
 
 		 297 aa  115  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  52.1 
 
 		 230 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 361 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.76 
 
 		 249 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 361 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  52.21 
 
 		 361 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  53.91 
 
 		 259 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.67 
 
 		 265 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  50.42 
 
 		 341 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50.42 
 
 		 342 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  44.08 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  50 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 257 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 246 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  49.59 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  55.36 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  46.9 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  46.9 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  46.9 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  52.68 
 
 		 224 aa  111  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  48.67 
 
 		 265 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  52.68 
 
 		 337 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 293 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  45.61 
 
 		 267 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 391 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  48.41 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  51.35 
 
 		 311 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 270 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  48.65 
 
 		 282 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 322 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  54.05 
 
 		 468 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  52.68 
 
 		 290 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  47.14 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.96 
 
 		 323 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.03 
 
 		 286 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 297 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 258 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  50.46 
 
 		 321 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  50.44 
 
 		 259 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.9 
 
 		 243 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  45.13 
 
 		 264 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  46.49 
 
 		 267 aa  107  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 474 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  48.06 
 
 		 295 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 455 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 367 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  47.54 
 
 		 171 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  54.05 
 
 		 279 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  38.06 
 
 		 381 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  57.94 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  48.25 
 
 		 260 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  50.91 
 
 		 281 aa  104  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  46.38 
 
 		 341 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  45.22 
 
 		 254 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  45.13 
 
 		 260 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 324 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 263 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  43.84 
 
 		 318 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 280 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  48.65 
 
 		 331 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  39.16 
 
 		 284 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 280 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 280 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  51.35 
 
 		 417 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 283 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  51.35 
 
 		 415 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  44.04 
 
 		 270 aa  103  9e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  46.09 
 
 		 388 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  48.36 
 
 		 314 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  63.22 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 324 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 408 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  51.67 
 
 		 314 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  55 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>