More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2474 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  100 
 
 		 195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  75.92 
 
 		 194 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  56.57 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  62.86 
 
 		 169 aa  184  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  64.44 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  48.9 
 
 		 163 aa  177  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  52.9 
 
 		 322 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  44.92 
 
 		 333 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  43.92 
 
 		 332 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  44.39 
 
 		 333 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  45.21 
 
 		 341 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  45.21 
 
 		 342 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  43.85 
 
 		 333 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  56.45 
 
 		 325 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  42.93 
 
 		 342 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  40.22 
 
 		 277 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  39.25 
 
 		 277 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  39.25 
 
 		 277 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  38.42 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  39.78 
 
 		 277 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56.56 
 
 		 337 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  43.24 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  38 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.88 
 
 		 342 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  50 
 
 		 335 aa  131  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  40.98 
 
 		 173 aa  131  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  41.15 
 
 		 474 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 468 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  45.28 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  41.76 
 
 		 265 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 455 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  37.19 
 
 		 280 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 264 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  42.68 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  42.68 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.59 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  53.72 
 
 		 314 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  41.95 
 
 		 442 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  54.62 
 
 		 297 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  52.89 
 
 		 312 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  52.07 
 
 		 315 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  51.18 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  52.8 
 
 		 295 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  35.75 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  38.14 
 
 		 278 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  45.14 
 
 		 281 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  40.78 
 
 		 293 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  52.99 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  51.24 
 
 		 339 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  51.24 
 
 		 283 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  38.22 
 
 		 297 aa  118  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  51.24 
 
 		 312 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 314 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  48.39 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 279 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  50.41 
 
 		 421 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  50.41 
 
 		 419 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  45.93 
 
 		 375 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  50.85 
 
 		 423 aa  114  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  35.98 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  44.29 
 
 		 417 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  48.76 
 
 		 415 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.62 
 
 		 286 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  38.8 
 
 		 361 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 382 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 243 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  42.04 
 
 		 263 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  54 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  35.53 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  35.98 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  48.76 
 
 		 424 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  47.15 
 
 		 270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  45.6 
 
 		 383 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  46.4 
 
 		 398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  45.52 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  49.19 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  45.53 
 
 		 381 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 258 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 408 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 282 aa  108  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  36.18 
 
 		 310 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  46.1 
 
 		 471 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  46.4 
 
 		 394 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  43.28 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  43.28 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  43.28 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  45.53 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  45.28 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  38.67 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 262 aa  106  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  38.67 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>