More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2856 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  72.9 
 
 		 171 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  73.2 
 
 		 169 aa  237  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  69.48 
 
 		 163 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  73.05 
 
 		 169 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  56.57 
 
 		 195 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  54.91 
 
 		 194 aa  192  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  44.38 
 
 		 312 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  51.94 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  52.71 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  44.52 
 
 		 367 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 342 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  54.03 
 
 		 342 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  50.77 
 
 		 314 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  53.23 
 
 		 342 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  53.23 
 
 		 341 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  53.23 
 
 		 337 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  53.23 
 
 		 335 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  49.61 
 
 		 315 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  49.33 
 
 		 279 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 282 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  44.97 
 
 		 312 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  50 
 
 		 325 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  49.59 
 
 		 474 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  49.59 
 
 		 455 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  50.81 
 
 		 333 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  48.46 
 
 		 314 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  42.01 
 
 		 283 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  48.76 
 
 		 468 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  50 
 
 		 332 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  50 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  45.16 
 
 		 224 aa  119  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  50 
 
 		 333 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  40.8 
 
 		 281 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  42.95 
 
 		 339 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  45.78 
 
 		 265 aa  117  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  51.59 
 
 		 260 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.99 
 
 		 265 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 259 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  44.91 
 
 		 264 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 311 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  48.74 
 
 		 297 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  51.69 
 
 		 318 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  44.67 
 
 		 321 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  39.47 
 
 		 243 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 278 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  47.62 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  47.46 
 
 		 270 aa  110  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  48.33 
 
 		 419 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  48.33 
 
 		 421 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 382 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 295 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  47.29 
 
 		 346 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  44.93 
 
 		 279 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 364 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  40.13 
 
 		 286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  43.14 
 
 		 263 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  41.52 
 
 		 267 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  45.6 
 
 		 286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 364 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 270 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  41.52 
 
 		 267 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 264 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  39.51 
 
 		 293 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 424 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  45 
 
 		 398 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.88 
 
 		 408 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  41.45 
 
 		 275 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  41.45 
 
 		 275 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  41.45 
 
 		 266 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  45.74 
 
 		 341 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 310 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  44.96 
 
 		 238 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 415 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 417 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0279  Rare lipoprotein A  48.74 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000131021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  46.22 
 
 		 254 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  45.6 
 
 		 361 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  41.43 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  45.6 
 
 		 361 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  44.53 
 
 		 383 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 249 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  46.22 
 
 		 240 aa  106  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  41.43 
 
 		 277 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  45.97 
 
 		 246 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  41.43 
 
 		 277 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  44.17 
 
 		 281 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 394 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  41.43 
 
 		 277 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 260 aa  104  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  47.01 
 
 		 322 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  42.14 
 
 		 370 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  44.93 
 
 		 333 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  46.61 
 
 		 239 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 297 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  43.33 
 
 		 280 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>