More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0923 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  100 
 
 
173 aa  360  4e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  51.16 
 
 
322 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  40.98 
 
 
195 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  48.44 
 
 
194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  42.17 
 
 
169 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  43.6 
 
 
267 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  43.6 
 
 
267 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  37.82 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  48.82 
 
 
337 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  44.94 
 
 
163 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  48.76 
 
 
311 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  52.94 
 
 
263 aa  117  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50.83 
 
 
342 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  40 
 
 
277 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  38.69 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
281 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  40 
 
 
277 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  40 
 
 
277 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  50.83 
 
 
341 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  40 
 
 
277 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.58 
 
 
265 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  47.69 
 
 
321 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  37.04 
 
 
265 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0279  Rare lipoprotein A  49.19 
 
 
172 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000131021  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  36.65 
 
 
278 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  43.33 
 
 
260 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  47.11 
 
 
280 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  47.11 
 
 
280 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  47.11 
 
 
280 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  45 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  39.87 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  40.85 
 
 
312 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  47.06 
 
 
342 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  48.46 
 
 
286 aa  111  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
295 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  41.98 
 
 
240 aa  111  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  40.27 
 
 
320 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  46.53 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  48.33 
 
 
325 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  44.08 
 
 
243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  45.9 
 
 
332 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  47.06 
 
 
333 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  49.12 
 
 
257 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  47.06 
 
 
333 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  52.63 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  52.63 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  47.46 
 
 
310 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  46.27 
 
 
275 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  45.9 
 
 
333 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  46.27 
 
 
275 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  46.27 
 
 
266 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  37.5 
 
 
293 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  39.76 
 
 
284 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  37.71 
 
 
264 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  48.25 
 
 
273 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  46.22 
 
 
269 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
335 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  41.06 
 
 
283 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  38.15 
 
 
297 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  39.58 
 
 
270 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  49.14 
 
 
238 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  42.36 
 
 
258 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  49.59 
 
 
259 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  39.74 
 
 
312 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  47.37 
 
 
273 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  37.8 
 
 
339 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  46.02 
 
 
474 aa  104  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  46.02 
 
 
455 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  39.74 
 
 
314 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  41.26 
 
 
290 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  38.3 
 
 
314 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
394 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  41.55 
 
 
297 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  51.28 
 
 
264 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  49.52 
 
 
127 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  43.44 
 
 
282 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  47.06 
 
 
333 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  51.43 
 
 
335 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  39.74 
 
 
314 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  37.64 
 
 
286 aa  102  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  45.13 
 
 
468 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  43.1 
 
 
367 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.88 
 
 
249 aa  101  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
279 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  39.86 
 
 
423 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
415 aa  100  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  41.61 
 
 
323 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  44 
 
 
303 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  39.05 
 
 
270 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  40.71 
 
 
417 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  44.62 
 
 
270 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  41.82 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  40.14 
 
 
361 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  40.14 
 
 
361 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  37.84 
 
 
281 aa  99.4  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  41.82 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  39.73 
 
 
324 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  41.38 
 
 
442 aa  99  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>