More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0279 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0279  Rare lipoprotein A  100 
 
 
172 aa  358  2e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000131021  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  49.19 
 
 
173 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  42.6 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  48.74 
 
 
154 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
163 aa  105  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
169 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
171 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  36.78 
 
 
312 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
364 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  41.83 
 
 
224 aa  97.8  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
364 aa  97.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  43.33 
 
 
194 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
275 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
266 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
275 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  45.08 
 
 
382 aa  94.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  42.15 
 
 
238 aa  94  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
195 aa  94.4  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  45.16 
 
 
424 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  42.4 
 
 
341 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  43.88 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  40.65 
 
 
255 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  42.14 
 
 
249 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  46.55 
 
 
421 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  46.55 
 
 
419 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  39.19 
 
 
322 aa  92  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  42.31 
 
 
394 aa  92  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  40.62 
 
 
312 aa  92  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  41.09 
 
 
367 aa  91.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  44.92 
 
 
279 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  42.02 
 
 
361 aa  90.5  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  40.29 
 
 
270 aa  90.5  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.83 
 
 
408 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  45.22 
 
 
342 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  41.46 
 
 
375 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  40.88 
 
 
391 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  37.67 
 
 
243 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  45.22 
 
 
341 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.63 
 
 
265 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  44.44 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  44.44 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  43.9 
 
 
260 aa  88.6  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  43.7 
 
 
322 aa  88.6  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  38.97 
 
 
370 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  39.13 
 
 
337 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  37.96 
 
 
360 aa  87.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  37.96 
 
 
360 aa  87.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  42.02 
 
 
346 aa  87.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  37.96 
 
 
360 aa  87.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  40.65 
 
 
388 aa  87.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  38.16 
 
 
281 aa  87.4  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  37.36 
 
 
339 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  42.74 
 
 
286 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  40 
 
 
258 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  45.77 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  41.88 
 
 
303 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  44.96 
 
 
282 aa  87  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  43.7 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  43.1 
 
 
283 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  41.53 
 
 
314 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
324 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  43.61 
 
 
265 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  39.58 
 
 
259 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  42.24 
 
 
315 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  33.88 
 
 
264 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  42.24 
 
 
314 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
474 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
455 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  40.15 
 
 
293 aa  84.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  41.8 
 
 
279 aa  84.7  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  42.02 
 
 
332 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  39.01 
 
 
417 aa  84.7  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  40 
 
 
311 aa  84.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  36.76 
 
 
277 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
264 aa  84.3  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  36.03 
 
 
281 aa  84  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  36.76 
 
 
277 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  45.36 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  36.9 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  42.02 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  36.76 
 
 
277 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  36.76 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  42.02 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  39.42 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  40.65 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  41.9 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  40.83 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  39.52 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  37.74 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  42.02 
 
 
468 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
398 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  40.15 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  46.94 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  40.5 
 
 
394 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  32.6 
 
 
377 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  32.6 
 
 
377 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  32.6 
 
 
377 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
442 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  36.84 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>