More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1199 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  100 
 
 		 361 aa  722    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  69.4 
 
 		 360 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  69.95 
 
 		 360 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  69.78 
 
 		 360 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  64.71 
 
 		 375 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  60.74 
 
 		 381 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  57.77 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  54.74 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  54.74 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  54.47 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  54.47 
 
 		 362 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3012  rare lipoprotein A  54.47 
 
 		 362 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000245758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  54.2 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1168  rare lipoprotein A  54.32 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  53.65 
 
 		 377 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  53.65 
 
 		 377 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  53.39 
 
 		 377 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  52.34 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0694  rare lipoprotein A  52.34 
 
 		 377 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  30.7 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  41.11 
 
 		 267 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  40.88 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  44.52 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  33.03 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  40.35 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  40.12 
 
 		 260 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  39.51 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  45.52 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  46.77 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  42.35 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  42.96 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  39.35 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  42.25 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  45.38 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  43.57 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  42.96 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  39.88 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  37.89 
 
 		 270 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  51.75 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  39.3 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  41.28 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  40.27 
 
 		 260 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  41.43 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  50 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  34.74 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  36 
 
 		 277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  36 
 
 		 277 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  36 
 
 		 277 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  35.69 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  32.04 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 424 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 314 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  48.12 
 
 		 186 aa  115  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  48.18 
 
 		 143 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  28.61 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  41.24 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  38 
 
 		 281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  34.84 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  48.7 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  30.77 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  30.74 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  47.41 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  39.77 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  50.89 
 
 		 332 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  38.8 
 
 		 195 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  45.11 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  29.97 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  50 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  50 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  40.56 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  30.41 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  30.74 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  41.98 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  30.82 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 468 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  45.08 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  39.25 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  46.96 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  48.7 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  48.7 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  49.55 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  44.53 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  29.44 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  48.21 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  40.79 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 124 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>